ارتكبت المجزرة منظمتان عسكريتان صهيونيتان هما "آرجون" (كان يتزعمها مناحيم بيغين آنذاك) و"شتيرن ليحي" (كان يترأسها إسحق شامير)، باتفاق مسبق مع عصابات "الهاجاناه" الصهيونية. وبدم بارد أجهزوا على مئات الأهالي في دير ياسين الفلسطينية، والتي كانت تعد نحو 750 نسمة، بهدف تهجير من بقي حياً منهم للاستيلاء على الأرض، وهي السياسة التي تقوم عليها سياسة الاغتصاب المتواصلة منذ قيام دولة إسرائيل حتى اليوم.
لم يستسلم أهالي دير ياسين كما توقع المعتدون، والذين بدأوا هجومهم على القرية قرابة الساعة الثالثة فجراً، وتفاجأوا بنيران الأهالي التي أوقعت 4 قتلى وما لا يقل عن 32 جريحاً في صفوف اليهود المتطرفين.
فاستقدم المعتدون إثر ذلك دعم عصابات "الهاجاناه"، وتمكّنوا من استعادة جرحاهم، وفتحوا نيران أسلحتهم على الأهالي دون تمييز بين رجل أو طفل أو امرأة.
ومع حلول الظهيرة، أصبحت القرية خالية تماماً من أي مقاومة، بعد أن عمدت قوات المنظمتين اليهوديتين إلى تفجير بيوت القرية بالديناميت أو الاستيلاء عليها بالكامل.
وتشير المعطيات التاريخية عن المجزرة بأن العصابات الغادرة هاجمت قرية دير ياسين الواقعة غربي مدينة القدس المحتلة من محاور عدة، مستغلين غياب رجال القرية الذين خرجوا للمشاركة في "معركة القسطل"، وآخرين ذهبوا للقدس للمشاركة في تشييع القائد عبد القادر الحسيني.
وتذكر التسجيلات التي كتبت عن تلك المجزرة، وتحديداً عن مندوب الصليب الأحمر الدكتور جاك دو رينيه، في حينه، بأن العصابات في تلك الليلة تجمعت وبكامل عتادها العسكري وباشرت بنسف بيوت القرية واحدًا تلو الآخر، وإحراق بيوت أخرى بمن فيها، فحاولت النساء والأطفال الخروج من القرية طلباً للنجاة، فما كان من العصابات الصهيونية إلا أن سارعت بحصد من وقع في مرمى أسلحتهم، وتم تمشيط القرية وتجميع من بقي على قيد الحياة وأطلقوا عليهم الرصاص، لتخلف المجزرة 360 شهيداً كما ورد بشهادته.
وبحسب روايات بعض ممن نجوا، فإن العصابات الصهيونية قامت بالتمثيل بالجثث، وبقر بطون النساء الحوامل والمراهنة على نوع الأجنة، وقتل الأولاد والتمثيل بهم أمام أعين أمهاتهم، وتقطيع الأيدي والأوصال والأعضاء التناسلية، وقتل الأحياء حرقاً، وترك الجثث بالعراء، إضافة إلى ممارسات مشينة ارتكبت بحق الفتيات الفلسطينيات الصغيرات، ومن ثم قاموا بذبحهن.
كما أُلقي 53 من الأطفال الأحياء وراء سور المدينة القديمة، واقتيد 25 من الرجال الأحياء في حافلات ليطوفوا بهم داخل القدس طواف النصر على غرار الجيوش الرومانية القديمة، ثم أعدموا رمياً بالرصاص. وألقيت الجثث في بئر القرية وأُغلق بابه بإحكام لإخفاء معالم الجريمة. بينما قام أفراد الهاجاناه الذين احتلوا القرية بجمع جثث أخرى في عناية وفجروها لتضليل مندوبي الهيئات الدولية وللإيحاء بأن الضحايا لقوا حتفهم خلال صدامات مسلحة.
وكانت هذه المذبحة، وغيرها من أعمال الإرهاب والتنكيل، إحدى الوسائل التي انتهجتها المنظمات الصهيونية المسلحة من تفريغ فلسطين من سكانها عن طريق الإبادة والطرد.
وقد عبَّرت الدولة العبرية عن فخرها بمذبحة دير ياسين، بعد 32 عاماً من وقوعها، حيث قررت إطلاق أسماء المنظمات الصهيونية: الإرجون، وإتسل، والبالماخ، والهاجاناه على شوارع المستوطنة التي أُقيمت على أطلال القرية الفلسطينية.
مجازر أخرى ومتتابعة ارتكبتها إسرائيل بحق الشعب الفلسطيني، كما لا تزال تقتل بدم بارد شباب وشابات فلسطين في الشوارع وعلى الحواجز، وتمعن في تمديد مستوطناتها دون رادع.
ذكرى راسخة في تاريخ الشعوب الحية الرافضة لكل أشكال الاحتلال واغتصاب الحقوق وهدر دم شعب همّه العيش بأرضه كأبسط حق من حقوق الإنسان.